待验证80% 置信事实时间未知
测序深度(reads数)决定低丰度菌的检出能力,16S检测建议测序量≥3万reads,宏基因组建议≥3G数据量,测序量过低会漏检占比小但重要的功能菌,报告中若未标注测序深度需警惕
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相关事实
待验证测序深度(reads数)直接影响低丰度菌种检出能力,宏基因组检测建议每样本≥3G数据量(约1000万-2000万reads),低于1G的检测对稀有致病菌和益生菌的报告可信度显著下降92% 相似待验证肠道菌群检测优先选择基于16S rRNA全长测序或宏基因组(shotgun)测序的产品,宏基因组可鉴定到菌株/物种级别且能检测功能基因,而普通16S V3-V4区测序只能到属级别,对'个性化补充建议'的支撑力弱很多74% 相似待验证采用宏转录组(RNA)测序而非16S rRNA测序,检测的是菌群活跃表达功能而非仅仅识别菌种存在,信息维度不同于大多数竞品73% 相似待验证采用宏基因组测序技术,相比16S rRNA测序能覆盖到菌种甚至菌株级别及功能基因通路,适合想深度了解肠道菌群全貌的用户72% 相似待验证16S rRNA测序能给出菌群相对丰度和多样性(如乳杆菌占比),但对具体致病菌种鉴定到种水平能力弱;宏基因组(mNGS)或靶向qPCR才能精确定量特定病原,追求诊断精度选后者72% 相似
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