IsoDDE

2026年2月，Isomorphic Labs发布Drug Design Engine（IsoDDE），技术报告称其在蛋白质-配体结构预测上的表现是AlphaFold 3的两倍，结合亲和力预测精度高于基于物理的方法，且时间和成本远低于后者。

IsoDDE能够发现蛋白质上的隐蔽口袋（仅在药物分子存在时才打开的隐藏结合位点），并模拟蛋白质在药物结合过程中的构象变化。