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采用宏基因组Shotgun测序，相比16S rRNA测序能识别到种/株水平，菌群分辨率更高，但价格也显著高于16S类产品
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Unverified采用宏基因组测序（mNGS），相比16S rRNA测序覆盖的微生物种类更广，可检测细菌、真菌、病毒、古菌等，但价格也明显更高84% similarUnverified16S rRNA测序能给出菌群相对丰度和多样性(如乳杆菌占比)，但对具体致病菌种鉴定到种水平能力弱；宏基因组(mNGS)或靶向qPCR才能精确定量特定病原，追求诊断精度选后者82% similarUnverified肠道菌群检测优先选择基于16S rRNA全长测序或宏基因组（shotgun）测序的产品，宏基因组可鉴定到菌株/物种级别且能检测功能基因，而普通16S V3-V4区测序只能到属级别，对'个性化补充建议'的支撑力弱很多82% similarUnverified采用16S rRNA测序技术，属于消费级肠道检测的基础方案，菌群覆盖广度和分辨率不如宏基因组测序产品80% similarUnverified16S rRNA测序仅能鉴定到菌属水平（genus），无法区分具体菌种和菌株，若需要精准评估致病菌或功能菌应选择宏基因组（shotgun metagenomics）测序，可鉴定到种（species）甚至株水平79% similar
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